LLM生成模型在生物单细胞single cell的应用：scGPT

article2024/5/17 16:47:36/文章来源:https://blog.csdn.net/weixin_42357472/article/details/137711223

参考：
https://github.com/bowang-lab/scGPT
https://www.youtube.com/watch?v=XhwYlgEeQAs

相关算法：
在这里插入图片描述

主要是把单细胞测序出来的基因表达量的拼接起来构建成的序列，这里不是用的基因的ATCG，是直接用的基因名称

训练数据：scGPT全人模型是在3300万个正常人类细胞的scRNA-seq单细胞测向数据上进行预训练的。
在这里插入图片描述

输入文本序列就是单细胞测序出来的基因表达量的拼接；模型还是GPT基本架构
在这里插入图片描述

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