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代谢组学及网络药理学研究技术与实践

时间:2021/5/20 16:39:01|来源:|点击: 次

1、代谢组学简介及样本的采集与制备关键问题探讨
1.1 代谢组学概述
1.2 代谢组学操作流程
1.3 样本的采集、储存与制备关键问题
2、代谢组学数据采集与预处理,决定数据统计结果的准确性
2.1 常用技术平台介绍(NMR和LC-MS)
2.2 常用软件和数据库介绍(代谢物鉴定、数据预处理与分析)
2.3 数据预处理,包括数据归一化、标准化和数据转化以及缺失值评估等
3、基于SIMCA-P软件的代谢组学数据多元统计分析与实操
3.1 样本分类(无监督和监督模式)
3.2 差异变量筛选(S-plot、S+V-plot、VIP、biplot等)
3.3 常见图形结果解读
4、网络药理学研究思路和流程
5、网络药理学数据分析与实操
5.1 化学成分的获取与筛选(Pubchem、TCMSP数据库、TCMID数据库、Swiss ADME数据库等)
5.2 中药化学成分靶点获取(TCMSP数据库、BATMAN-TCM数据库、Similarity Ensemble Approach (SEA)数据库、HitPick数据库、Swiss Target Prediction数据库等)
5.3 疾病靶点富集数据库(DisGeNET数据库、GeneCards数据库、OMIM数据库等)
5.4 化合物与疾病靶点映射(韦恩图)
5.5 PPI网络分析(PPI网站的构建、PPI核心网络的筛选)
5.6 富集分析(DAVID数据库、Metascape 数据库)
5.7 网络图构建—Cytoscape(数据导入、节点关系的建立、节点属性计算、调整网络样式、筛选及过滤、网络图导出)
6、代谢组学与网络药理学结合研究思路
7、代谢组学与网络药理学结合分析技术
7.1 代谢组学与网络药理学数据的获取(HMDB数据库、成分靶点获取、疾病靶点富集数据库、 代谢专属数据库)
7.2 代谢组学功能分析(富集分析、通路分析等)
7.3 代谢小分子网络关联分析(Metscape软件、KEGG数据库、OmicsNet数据库)
7.4 代谢组学与网络药理学功能层次关联分析
8、文献解读:代谢组学与网络药理学结合的文章分析流程和套路
8.1 中药化学成分靶点与代谢小分子网络分析实例
(Food Res Int. 2020, 136:109503)
创新点:采用Metscape软件对代谢组学发现的差异代谢物和中药成分的药物靶点关联,聚焦关键蛋白。
8.2代谢组学与网络药理学功能层次关联分析实例
(J Ethnopharmacol. 2021,264:113281. )
创新点:采用功能富集工具分别对网络药理学和代谢组学数据进行关联,聚焦关键通路。
8.3代谢组学和网络药理关联分析实例
(Comput Struct Biotechnol J. 2021, 19:1002-1013)
创新点:整合代谢组学和网络药理学揭示羟基红花黄色素A抗急性脑外伤的作用机制损伤。
时间:
2021年06月19日-06月20日
2021年06月26日-06月27日
1455609108(微信)

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