成功案例(IF=7.3)| 转录组+蛋白质组+代谢组联合分析分析揭示胰腺癌中TAM2相关的糖酵解和丙酮酸代谢重构

图片

研究背景

肿瘤的进展和发展需要癌细胞的代谢重编程,癌细胞能量代谢模式的改变可以满足快速增殖和适应肿瘤微环境的需要。肿瘤微环境(TME)中的代谢状态受到多种因素的影响,包括血管生成、与其他细胞的相互作用和系统代谢。代谢异质性可影响治疗效果,并可能预测临床结果。然而,很少有研究关注基于代谢异质性来区分亚型的方法。

胰腺癌(PAAD)是一种预后不良、死亡率高的恶性肿瘤。肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的大量浸润是PAAD的一个显著特征。TAMs可与胰腺癌细胞相互作用,调节代谢、炎症和免疫状态,形成免疫抑制TME,最终促进肿瘤的发生和发展。研究表明,巨噬细胞会影响胰腺癌细胞的生物学功能,如葡萄糖代谢。然而,目前仍缺乏一种结合TAM和代谢相关特征来识别PAAD新分子亚型的方法。代谢亚型为新一代癌症治疗的患者分类提供了一个独特的视角,因此,根据免疫代谢特性开发新的分子亚型对提高精准医疗至关重要。

本研究中,作者根据多组学方法将PAAD分为4个具有不同免疫代谢特征的代谢亚型,并探讨了检测到的代谢亚型在PAAD的临床特征、预后和治疗中的作用,旨在为PAAD的免疫治疗提供新的认识。

研究思路

图片

研究结论

在本研究中,作者基于多组学分析策略,将PAAD样本分为具有不同代谢特征的分子亚型。收集20个PAAD组织和10个正常胰腺组织用于蛋白质组学和代谢组学分析。来自TCGA-PAAD队列的RNA测序数据用于转录组学分析。采用免疫组化方法评估PAAD组织中TAM2的浸润情况。转录组学和免疫组化结果显示,PAAD中TAM2浸润水平上调,并与患者预后不良相关。蛋白质组学和代谢组学结果表明,PAAD中多种代谢过程被异常调控,这种失调与TAM2浸润水平有关。WGCNA证实了丙酮酸和糖酵解/糖异生是TAM2在PAAD中共同表达的代谢途径。基于转录组数据,作者将PAAD样本分为4种与TAM2相关的代谢亚型。代谢亚型各具有临床预后、肿瘤微环境、免疫细胞浸润、化疗药物敏感性和功能机制等特征。该研究证实了PAAD中丙酮酸的代谢重构和糖酵解/糖异生与TAM2密切相关,且基于TAM2相关代谢通路的分子亚型为PAAD患者的预后预测和治疗提供了新的见解。

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.mfbz.cn/a/599165.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系我们进行投诉反馈qq邮箱809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

Python中批量提取[]括号内第一个元素的四种方法

目录 一、引言 二、方法介绍 使用正则表达式(Regular Expression) 使用字符串分割(String Split) 使用ast模块解析字符串为列表 使用JSON模块解析字符串 三、方法比较与选择 四、总结 一、引言 在Python数据处理过程中&a…

探索1688、淘宝、京东搜索商品聚合API接口:一站式电商搜索解决方案

随着电商行业的不断发展,电商平台的数量和商品种类都在快速增长。商家和开发者在运营过程中,需要经常进行跨平台的商品搜索和数据分析。然而,由于各个电商平台的数据接口存在差异,直接对接多个平台不仅效率低下,而且维…

仓库管理员如何入门?仓库管理六大步骤教会你!

新手菜鸟入行,如何做好一个仓库管理员?仓库运营对于许多行业至关重要,例如制造、零售和物流。它们涉及高效、安全地接收、仓储、拣选、包装和运输货物。 跟着这6个步骤做,最慢一个月,最快一周,就能轻松做好…

42.乐理基础-拍号-看懂拍号的意义

到这必然是已经知道 X、Y的意思了: 然后带入数字: 然后念拍号的时候,在国内,百分之九十的地方是从下往上念,念作四二拍,还有百分之十的地方是和国外一样,从上往下念,念作二四拍&…

GPS与精致农业 无人机应用 农业遥感 农业类

全球定位系统是美国国防部主要为满足军事部门对海上、陆地和空中设施进行高精度导航和定位的要求而建立的。GPS系统最基本的特点是以“多星、高轨、高频、测量-测距”为体制,以高精度的原子钟为核心。GPS作为新一代卫星导航与定位系统,不仅具有全球性、全…

大模型外推能力

一、目录 定义如何提高模型的外推能力?分类测评方法各技术点,以及应用模型,优缺点支持模型长上下文的方案「NTK-aware interpolation」的思路是什么?LLM长度外推方案NTK-by-parts的思路是什么?LLM长度外推方案YaRN是怎…

普通组件的注册-局部注册和全局注册

目录 一、局部注册和全局注册-概述 二、局部注册的使用示例 三、全局注册的使用示例 一、局部注册和全局注册-概述 组件注册有两种方式: 局部注册:只能在注册的组件内使用。使用方法:创建.vue文件,在使用的组件内导入并注册。…

编程语言QT、C++、C#、Matlab、SQL Server开发日志总结

目录 引言 正文 1、Qt连接SQL server数据库 2、C#使用chart绘制实时折线图,波形 3、ORACLEXE数据库 4、QT通过ODBC驱动连接Oracle数据库 5、Microsoft SQL Server 2014 安装图解 6、SQL Server 2014应用 7、C/C​​​​​​​ 8、QT…

vue2后台管理项目

一:项目准备 1)拉取模板代码 远程仓库复制到本地仓库. 2)安装后的项目 路径 code 文件夹 会打开vscode的文件夹. 3)安装vetur和eslint插件可以保存时自动修改不规范的地方. 4)App内有一级路由,路由组件导入如果是layout架子,会导入的是文件夹下的index.js没有则导入index.v…

深度学习实战76-基于目标检测YOLOv5模型的迁移学习使用方法,YOLOv5的原理与结构

大家好,我是微学AI,今天给大家介绍一下深度学习实战76-基于目标检测YOLOv5模型的迁移学习使用方法,YOLOv5的原理与结构。YOLOv5(You Only Look Once version 5)是一种先进的目标检测算法,基于深度学习的单阶段目标检测模型。它的主要原理是通过一次前向传播就同时预测图像…

【Python】字典题

题目:输入一段文本,统计每个字符的个数 in_inputinput(“输入:”) dic{} for char in in_input: if char in dic: dic[char]1 # 字典添加键值对的方法,给字典给键和值的方法 else: dic[char]1 print(dic) for key,value in dic.i…

6、随机森林(Random forests)

Random forests started a revolution in machine learning 20 years ago. For the first time, there was a fast and reliable algorithm which made almost no assumptions about the form of the data, and required almost no preprocessing. In today’s lesson, you’ll…

Apache SeaTunnel 正式发布2.3.5版本,功能增强及多个Bug修复

经过两个月的筹备,我们在2.3.4版本基础上进行了新一轮的迭代,本次更新不仅修复了多个关键问题,还引入了若干重要功能增强和性能优化。 在此,我们先提前感谢社区成员的贡献和支持,如果你想升级最新的版本,快…

26 JavaScript学习:JSON和void

JSON 英文全称 JavaScript Object NotationJSON 是一种轻量级的数据交换格式。JSON是独立的语言JSON 易于理解。 JSON 实例 简单的 JSON 字符串实例: "{\"name\": \"Alice\", \"age\": 25, \"city\": \"San Francisco\&…

【陀螺仪JY61P维特智能】通过单片机修改波特率和角度参考的方法

根据官方文档: 修改波特率 1.解锁:FF AA 69 88 B5 1.1延时200ms 2.修改波特率:FF AA 04 06 00 2.1切换已修改的波特率然后重新发送解锁和保存指令 2.2解锁:FF AA 69 88 B5 2.3延时200ms 4.保存: FF AA 00 00 00 XY轴角度参考 角度参考是以传感器当前的实际位置&…

8款常见的自动化测试开源框架

在如今开源的时代,我们就不要再闭门造车了,热烈的拥抱开源吧!本文针对性能测试、Web UI 测试、API 测试、数据库测试、接口测试、单元测试等方面,为大家整理了github或码云上优秀的自动化测试开源项目,希望能给大家带来…

近似消息传递算法(AMP)单测量模型(SMV)

1、算法解决问题 很多人致力于解决SLM模型的求逆问题,即知道观测值和测量矩阵(字典之类的),要求未知变量的值。SLM又叫做标准线性模型,后续又在此基础上进行升级变为广义线性模型。即SLM是yAxe,这里是线性…

数据分析必备:一步步教你如何用numpy改变数据处理(6)

介绍: NumPy 广播(Broadcasting)是指当两个形状不同的数组进行运算时,NumPy 有能力灵活地改变其中某个(些)数组的形状从而使得运算可以正常进行。 广播的规则主要包括以下几点: 当一个数组是一个…

C语言 函数概述

好 接下来 我们来讲函数 构建C程序的最佳方式 就是模块化程序设计 C语言中 最基本的程序模块被称为 函数 所以 这个知识点的重要性不言而喻 这里 我们讲个故事 诸葛亮六出祁山时 为了逼司马懿出战 派人送给力司马懿一件女人衣服 司马懿只是为使者 诸葛亮的饮食起居 使者感叹…

网络 IO 模式

同步 IO 与异步 IO 同步 IO 和异步 IO 是关于数据读写方式的两种不同模式。 同步 IO 是指在程序读写数据时,需要等待操作完成后才能继续执行后面的程序。这种模式下,当程序使用阻塞式 IO 时,会一直等待IO操作完成,程序会暂停执行…
最新文章