代谢组学实验伯远生物代谢组学实验

伯远生物是国家级专精特新小巨人企业，农业农村部生物育种重点实验室，牵头多项省部级重大专项，公司科研技术人员500+（硕博占比40%以上），是国内最大植物功能基因研究综合性平台
15年技术沉淀，每年完成功能基因研究数量50000+，长期服务课题组10000+（含清北、复旦、武大、华科等知名高校及所有农业类科研院所），服务头部种业公司客户300余家，涉及四十多个物种（含水稻、玉米、小麦、马铃薯、大豆五大主粮以及禾本科高粱、甘蔗，葫芦科黄瓜、西甜瓜，茄科番茄、辣椒与十字花科等），100多个品种的50多个性状（含抗虫抗病、抗除草剂、品质提升、株型改良等）
各类仪器设备投资超1个亿，高标准恒温繁育基地200+亩

案例展示

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期刊：Plant Cell & Environment

影响因子：7.3

发表年份：2021

一、研究背景

植物侧根的发育受内源激素信号和外部环境因素的协同调控。根际微生物作为重要的生物因子，可以通过促进根细胞分裂和分化而显著影响根的发育。然而目前对根际微生物调控植物侧根发育的活性物质和调控机制尚不完全清楚。

二、研究结果

根际促生菌解淀粉芽孢杆菌SQR9产生的挥发性物质，可诱导主根上的大量形成侧根起始点；还可以增强侧根原基的生长素信号，促进早期侧根原基起始和后期侧根原基的发育，导致主根上形成更多的侧根；SQR9对侧根形成的调控受到生长素信号通路、极性运输等的介导。

图 解淀粉芽孢杆菌诱导拟南芥侧根发育的分子模型

参考文献：

Yucong L, Jiahui S , Yuanming X, et al. Volatile compounds from beneficial rhizobacteria Bacillus spp. promote periodic lateral root development in Arabidopsis[J].Plant Cell & Environment,2021,44:1663–1678.

背景说明

背景说明

GC-MS挥发性代谢组学一种基于GC-MS技术对生物样本中的代谢物进行定性和定量分析的常用代谢组学研究方法。该方法具有敏度高、定性能力强，稳定可靠等优点。GC-MSS挥发性代谢组检测的物质是挥发性及部分半挥发性物质，如醇类、醛类、酮类、烃类、酯类等。通过对实验组和对照组样本中的这些代谢物进行分析，找到差异代谢物，为植物生长发育研究、植物逆境胁迫研究等研究提供方向。

服务流程

服务流程

客户在线下单——样本信息及分析需求的确认——样本制备——GC-MS分析——代谢物定性定量分析——单变量/多元统计学分析——差异代谢物分析——功能富集及注释分析——结果交付

图 非靶向代谢组学技术流程

服务内容及说明

服务内容及说明

技术优势

1、通量高：一次性对样本中所有代谢物进行全面检测分析；

2、质控严格：采用最严格的QC系统，保证每个项目的定性定量结果；

3、数据质量高：高标准的谱图匹配

4、优质服务：专业的售前售后及文章写作全面辅导

适用场景

1、植物的生长发育

2、植物成色机理研究

3、生物胁迫与非生物胁迫

4、植物物质合成通路研究

样品要求

客户下单及项目信息填写

在我司官网http://plant.biorun.com/进行注册或登录，请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式，提交项目所需要的具体信息，包括：

1、样品来源、含量、状态及其他基本信息；

2、生信分析的具体需求。

实验信息

实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户，并发送实验报告查看网址。实验结题后，实验报告、检测结果可在线查看或打印。

实验交付内容

1、完整的结题报告；

2、生物信息学分析结果包括：

a、数据质控分析（QC、RSD）；

b、代谢物的差异分析：（单变量统计分析、PCA、OPLS-DA、差异代谢物热图、差异代谢物火山图、韦恩图、差异代谢物VIP图等）；

c、功能注释分析：层级聚类分析、KEGG注释分析、KEGG富集分析。

代谢组学实验通常由研究设计、样本准备、仪器检测、数据处理与生物学解释四个部分组成，核心目标是在控制混杂因素和批次效应的前提下，可靠地捕捉样本中代谢物的差异变化。
1.研究设计
先明确科学问题：疾病机制、标志物筛选、药物响应、环境应激或多组学整合。
明确样本类型：血清、血浆、尿液、组织、细胞、植物材料或微生物提取物等。代谢组学实验
设计分组、重复数和时间点，优先保证生物学重复和对照匹配。
2.样本准备
采样要标准化，尽量避免溶血、反复冻融和长时间室温放置。